Opiekun naukowy

Imię i nazwisko :	Ewa Ł. Stępień
Email:	e.stepien@uj.edu.pl
Zakład:	Zakład Fizyki Medycznej
Pracownia:
Strona www grupy:	http://www.zfm.if.uj.edu.pl/

---

Krótki opis

Praca magisterska ma na celu wykorzystanie metod obrazowania mikroskopowego i cytometrii obrazowej fluorescencyjnej, do oceny dynamiki wzrostu komórek czerniaka w hodowlach 3D. W pracy wykorzystane będę podstawowe techniki analizy kształtu z zastosowaniem programów użytkowych do stworzenia bibliotek danych.

W przyszłości dane te posłużą do głębszej analizy ilościowej i jakościowej z wykorzystaniem metod uczenia maszynowego.

Główny nacisk w pracy magisterskiej położony będzie na badania laboratoryjne prowadzące do uzyskania powtarzalnych hodowli 3D w różnym stadium wzrostu komórek czerniaka. Otrzymane sferoidy będą poddawane testom biologicznym (testy inwazji,) i oceniana będzie dynamika zmiany kształtu sferoidy po zadziałaniu bodźca stymulującego.

Główne narzędzia badawcze

• hodowle komórkowe, cytometria obrazowa, cytometria przepływowa, preparatyka oparta o metody wirownia, techniki obliczeniowe do analizy kształtu (podstawowe parametry do oceny wielkości i regularności).

Wymagania w stosunku do kandydata

• Zdolności manualne
• Praca w laboratorium komórkowym
• Analiza obrazu z wykorzystaniem programu Fiji ImageJ.